Лотос относится к виду водных многолетних травянистых растений, корневище которых вырастает до высоты 150 сантиметров и в длину распространяется на 3 метра. Стебель округлый, длиной 60-90 сантиметров, голый, сизый, темно-зеленый, покрыт сетью микроскопических волосинок; черешки длинные, возвышаются над водой. Листья подводные, плавающие и надводные. Цветок одиночный, до 24 сантиметров в диаметре; чашелистики эллиптические или яйцевидные, размеры 1,5-5×1-3,5 сантиметров, вогнутые, зеленые или розовато-зеленые. Лепестки эллиптические, 4-15×2-8 сантиметров, вогнутые, цвет зависит от вида. Тычинки многочисленные.

Плод — орехоподобное семя, продолговато-яйцевидной формы.