Автоматизация зоомагазина и организация учета зоомагазина практически не отличаются от любой другой отрасли торговли, при этом важно учитывать специфику товаров, которые продаются. Для продажи зоотоваров встречаются различные форматы магазинов – зоосупермаркеты с большим ассортиментом, зооларьки (МАФы), зоо-отделы в магазинах. Зачастую офлайн розница поддерживается также онлайн интернет-магазином с адресной доставкой зоотоваров.